Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms