Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms