Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN9O14815 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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