Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SRRM3A6NNA2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRRM3A6NNA2 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms