Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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