Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPAP2Q8IXW5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms