Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C4orf17Q53FE4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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C4orf17Q53FE4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C4orf17Q53FE4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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