Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms