Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD9Q3L8U1 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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