Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SIX1Q15475 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SIX1Q15475 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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