Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL1Q13616 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL1Q13616 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL1Q13616 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL1Q13616 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL1Q13616 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CUL1Q13616 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CUL1Q13616 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CUL1Q13616 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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