Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC109597.1-201ENST00000564016 786 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC139099.1-203ENST00000570366 607 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 OR52B5P-203ENST00000641694 1313 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC015878.2-201ENST00000584331 361 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 AC132216.1-201ENST00000610375 1158 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MKRN4PQ13434 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms