Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC244093.4-201ENST00000620689 710 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNB1Q02641 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SPATA22-203ENST00000397168 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ZNF506-202ENST00000450683 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC013451.2-201ENST00000556652 667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 CNIH1-202ENST00000395573 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CACNB1Q02641 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.4 ms