Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CLTCQ00610 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms