Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLCNKBP51801 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms