Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF4P48230 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms