Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms