Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms