Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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