Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RCCD1A6NED2 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms