Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RRN3P1Q2M238 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms