Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ZNF56Q15929 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms