Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CACNB2Q08289 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNB2Q08289 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms