Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SRSF4Q08170 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms