Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHRNA7P36544 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms