Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPB2P35606 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPB2P35606 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COPB2P35606 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms