Protein–RNA interactions for Protein: C9J2C7

NT5C1B-RDH14, NT5C1B-RDH14 readthrough (Fragment), humanhuman

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Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C1B-RDH14C9J2C7 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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NT5C1B-RDH14C9J2C7 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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