Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HELTA6NFD8 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms