Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V9GYV3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
V9GYV3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
V9GYV3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
V9GYV3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
V9GYV3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
V9GYV3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
V9GYV3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
V9GYV3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
V9GYV3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
V9GYV3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
V9GYV3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
V9GYV3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
V9GYV3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V9GYV3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V9GYV3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V9GYV3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
V9GYV3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V9GYV3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V9GYV3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms