Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC23IPQ9Y6Y8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC23IPQ9Y6Y8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms