Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED16Q9Y2X0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MED16Q9Y2X0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MED16Q9Y2X0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms