Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHF24Q9UPV7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF24Q9UPV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF24Q9UPV7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF24Q9UPV7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF24Q9UPV7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF24Q9UPV7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF24Q9UPV7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF24Q9UPV7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms