Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TNRC6BQ9UPQ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNRC6BQ9UPQ9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNRC6BQ9UPQ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms