Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PADI4Q9UM07 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PADI4Q9UM07 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms