Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC24A2Q9UI40 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC24A2Q9UI40 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC24A2Q9UI40 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms