Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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