Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PSMC3IPQ9P2W1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMC3IPQ9P2W1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms