Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
ARHGEF12Q9NZN5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms