Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LTBP3Q9NS15 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LTBP3Q9NS15 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LTBP3Q9NS15 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms