Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDE7BQ9NP56 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE7BQ9NP56 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
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