Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CYP4F12Q9HCS2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CYP4F12Q9HCS2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms