Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9J2

MRPL44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL44Q9H9J2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL44Q9H9J2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRPL44Q9H9J2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL44Q9H9J2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL44Q9H9J2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL44Q9H9J2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL44Q9H9J2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL44Q9H9J2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL44Q9H9J2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL44Q9H9J2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL44Q9H9J2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms