Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCL3Q9H2J4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms