Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL4Q9C0H6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL4Q9C0H6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms