Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GSDMCQ9BYG8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMCQ9BYG8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMCQ9BYG8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms