Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN3Q9BQT9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLSTN3Q9BQT9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSTN3Q9BQT9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms