Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX7

C7orf25, UPF0415 protein C7orf25, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf25Q9BPX7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C7orf25Q9BPX7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C7orf25Q9BPX7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms