Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPN18Q99952 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPN18Q99952 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPN18Q99952 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms