Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEBP4Q96S96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEBP4Q96S96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms