Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GBP4Q96PP9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GBP4Q96PP9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GBP4Q96PP9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms